— Да.
— А кресты и пятиугольники — это?..
— Пятиугольники — это дезоксирибоза, а звезды — поддерживающие молекулы фосфата.
— И из них сделаны рельсы?
— Фосфатные звезды формируют внешний каркас, о котором спорили Уотсон и Крик. Каждая молекула сахара соединяет каркас со шпалой.
— А светящиеся линии между атомами — это стабильные ковалентные связи?
— Да. Фосфаты скрепляют всю конструкцию воедино, а сахар соединяет рельсы со шпалами. Кстати, пора бы присмотреться к ним повнимательнее.
Я позволяю вам медленно пройтись вдоль путей, рассматривая шпалы.
— Они прикрепляются к внутренним углам каждого пятиугольника?
— А что еще вы видите?
— Каждая шпала состоит из двух деталей, соединенных посередине.
— Да, это два комплементарных нуклеотида, но на самом деле соединение не расположено точно в центре.
— Это было бы странно, ведь комплементарные нуклеотиды имеют разную структуру. Вот здесь соединение ближе к верхнему рельсу, а в следующей шпале — к нижнему.
— Пурины (гуанин и аденин — Г и А) шире, потому что содержат по два смежных атомных кольца. А пиримидины (тимин и цитозин) короче, потому что в их состав входит только по одному кольцу.
— Получается, что, так или иначе, шпала всегда состоит из одного пурина и одного пиримидина?
— Да. Это-то и объясняет их форму. Присмотритесь к соединению в центре шпалы и обратите внимание, как совпадают стыки нуклеотидов. Вам не кажется, что это на что-то похоже?
— Да, как будто два соединенных кусочка пазла.
— Именно.
— Поэтому они комплементарны?
— Да. Теперь вы понимаете, почему молекула имеет именно такое строение?
— Значит, в настоящем ДНК нуклеотиды похожи на бусины, нанизанные на леску из фосфатов и сахаров?
— Нет. Был один ученый, кажется, математик, который привел Крику такое сравнение. Но он был не прав. Крик ответил ему, что леска — это вся ДНК.
— ДНК включает и фосфаты, и сахара, не только нуклеотиды, так?
— Да. Вся молекула должна иметь именно такую структуру. Вы понимаете почему?
Вы еще раз прогуливаетесь вдоль полотна, обдумывая мой вопрос.
— Нуклеотиды, то есть основания, не контактируют между собой по всей длине цепи?
— Нет. Они встречаются лишь парами и формируют шпалы. И у них всегда есть комплементарные партнеры. А соединяются они с Т, Г с Ц или наоборот.
Несколько секунд вы рассматриваете лежащее перед вами биологическое чудо.
— Получается, код заключен в шпалах?
— Именно. Они же объясняют, как этот код реплицируется и формируется новая дочерняя нить ДНК и как код из генов транслируется в белки. Важно понять, что код содержится в каждом из рельсов. Если мы возьмем верхний рельс, то код будет определяться последовательностью из половинок шпал. Вы можете его прочитать, достаточно лишь пройти вдоль путей, называя каждый из нуклеотидов своей буквой.
— Давайте я попробую. А, А, Ц, Т, Г, Ц… Кажется, я понимаю, как это работает. Но зачем нужен второй рельс?
— Код уже скопирован на дочернюю нить. На втором рельсе вы видите такую копию.
— Ага! Выходит, двойная спираль — это на самом деле две копии кодирующей ДНК?
— Да, две взаимодополняющие последовательности. Хотите посмотреть, как она копирует сама себя?
— Конечно!
Мы отходим на пару шагов от полотна, из нашего паровоза вырывается облако дыма. Рельс начинает вибрировать.
— Что происходит?
— Для того чтобы скопировать саму себя, двойная спираль должна разделиться на отдельные нити. Обычно это происходит под влиянием энзима, но простого нагревания тоже достаточно. Тепло дает энергию, которая позволяет разорвать связи между шпалами.
— Значит, связи, которые удерживают шпалы вместе, нестабильны?
— Да. Это достаточно слабые водородные связи, которые мы упоминали, когда говорили о Лайнусе Полинге и его исследованиях.
Мы смотрим, как шпалы расходятся, будто кусочки мозаики. На горизонте появляется облако и начинает двигаться вдоль верхнего рельса с его половинками шпал.
— Что это?
— Это облако — энзим, белок под названием синтетаза, который способствует репликации ДНК.
Мы смотрим, как облако скользит вдоль отделившегося рельса слева направо. Оно выбирает из окружающей среды необходимые нуклеотиды и соединяет их с парами — А с Т, Ц с Г, Т с А и Г с Ц. Еще один элемент облака, вероятно, другой энзим, собирает необходимые фосфаты и сахара и строит второй рельс.
Вы так поражены скоростью этой работы, что не в состоянии вымолвить ни слова. Облако проносится мимо нас всего за несколько секунд, и вот уже перед нами простирается новенький сверкающий путь.
— И это все?
— Почти. Но перед тем, как мы поедем домой, я хотел бы показать вам еще кое-что. Нам нужно будет проехать по этому новому пути.
В мгновение ока перед нами появляется волшебный поезд, готовый к продолжению путешествия. Мы заходим в него, даем сигнал и на всех парах мчимся на восток.
— Следите, когда впереди покажется красный свет.
Через несколько километров вы замечаете на горизонте красное сияние.
— Он прямо на нашем пути, справа.
— Да. Должно быть, он льется из дочерней копии.
Я объясняю вам, что рельс, расположенный ближе к нам, называется смысловой нитью, а другой путь, то есть дочерняя копия, — антисмысловой. Генетические механизмы считывают эту информацию по мере движения в противоположном направлении. Я глушу двигатель, чтобы мы могли понять, что означает красный свет.
— Смотрите на шпалы.